Nació en S. Antonio Tultitlán, Méx., el 28 de Abril de 1949, sus Padres: Rafael Flores Ortiz y María Luisa Calzada San Román. Inició la Diócesis de Valle de Chalco con 55 sacerdotes diocesanos y 23 religiosos, haciendo su labor pastoral en 51 parroquias organizadas en cinco Vicarias Foráneas.
Impulsó la comisión para las vocaciones sacerdotales y religiosas, estableció la Vicaria de Vida Consagrada. Inició el Seminario Diocesano, promovió la fraternidad y la formación permanente de los sacerdotes agrupándolos por generaciones
Para la participación de los fieles organizó un programa de visita pastoral, instituyó la comisión de ministerios y movimientos laicales.
Puso los cimientos del proyecto de Renovación Pastoral con Metodología Prospectiva.
El 30 de marzo de 2012 su Santidad Benedicto XVI lo nombró Obispo de la Diócesis de Tepic, de la cual tomó posesión el 18 mayo del mismo año.